免税事業者の方及び、免税事業者と取引されている方は、インボイスについて対策を考える必要があります。
インボイス制度は、つまるところ、得意先と免税事業者間でどちらが納税の負担をどれだけ負うか、というジョーカーの取り合いの側面があります。
この観点から作成したインボイス対応策を下記URLより閲覧することが出来ます。
これを参考頂いて、免税事業者と得意先でインボイスにより発生する負担の適切な分配を検討されると良いかと思います。
YouTubeにて動画解説もアップしておりますので、そちらを視聴されるとより理解が深まるでしょう。